Rất nhiều thiếu sót, sai phạm liên quan đến tài chính, kế toán như để thất lạc chứng từ, tùy tiện chi tạm ứng tại xã Bình Hưng, huyện Bình Chánh.

Theo Chủ tịch UBND TP.HCM Nguyễn Thành Phong, có lần, ông đã nói với ông Nguyễn Toàn Thắng nên để người khác làm thay nhiệm vụ Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường TP.HCM.